Kucrietzlophbatman's Weblog

WISATA KE KALIGOA

A26149 kucrietz — Fri, 17 Oct 2008 13:53:09 +0000

WiSaTa ke kaLiGoa

LeBaRan tLaH berLalu

tApi kEiNdaHanNya mAsiH bErtaLu

tAkKan PeRNaH tErNodA oLeh rAsA mALu

kEtiKa QtErjAtuH mEmbEnTuR bAtu

yAng sEkeRaz pALu

kAreNa Q tAhuuu

WajAhQ iNi tEtAp Ayuuu

bAgAiKan sAng RaTu…

Uuuppzzz……..Sory!!!!!

NaRsiZzzz AdaLaH nAma bELakAngQ,,,

Ni FOTOnya

iNdahnyaaaaa kOtAQuW…

soal

A26149 kucrietz — Mon, 13 Oct 2008 15:26:24 +0000

Uji Nyali Kuis Harian 4 Teknik untuk Mempelaj… » Quiz Maker

Berbagai tipe RNA dan DNA transposon serta jalur transposisi DNA

A26149 kucrietz — Thu, 09 Oct 2008 14:14:25 +0000

Berbagai tipe RNA dan DNA transposon serta jalur transposisi DNA

Nama : Citra Dewi Febriani
NIM : B1J006149
Kelas : A2
Email : kucrietz_1022ak@yahoo.co.id
Blog : http://kucrietzlophbatman.wordpress.com
Jenis Topik : A2-AG12

Ringkasan

Tandemly repeat DNA diperkirakan muncul karena adanya perluasan original sequences, baik melalui replikasi seperti pada mikrosatelit maupun melalui proses rekombinasi DNA. Sedangkan Interspersed repeats muncul melalui mekanisme yang berbeda, yaitu melalui sebuah mekanisme dimana hasil ’copy’ dari unit repeat terlihat dalam genom pada posisi yang jauh dari original sequencesnya. Mekanisme ini sering terjadi melalui transposisi.
Transposisi adalah pergerakan segmen DNA ke posisi yang berbeda dalam genom. Terdapat dua alternatif model transposisi, yaitu transposisi yang melalui RNA intermediet dan transposisi yang tidak melalui RNA intermediet.
Transposisi yang melalui RNA intermediet disebut retrotransposition dan mekanisme dasarnya meliputi:
1. RNA copy dari transposon disintesis melalui proses transkripsi secara normal.
2. RNA hasil transkripsi kemudian dicopy ke DNA. Perubahan dari RNA ke DNA ini berlawanan dengan transkripsi normal, sehingga memerlukan enzim khusus yaitu enzim reverse transkriptase.
3. DNA copy dari transposon bergabung kembali ke dalam genom pada kromosom yang sama dimana unit original berada, namun dapat juga bergabung dengan kromosom yang berbeda.

Mekanisme diatas dapat dilihat pada gambar 1:

Gambar 1. Mekanisme Retrotransposition
Sumber : Figure 2.26 (Brown, 2002)

RNA transposons (retroelement) dapat dikelompokkan menjadi dua yaitu retroelement yang memiliki Long Terminal Repeat (LTR) dan yang tidak memiliki LTR atau retroposons. Type retroelement yang memiliki LTR anatara lain retroviruses, endegenous retroviruses dan retrotransposon. Seadangkan Type retroelement yang tidak memiliki LTR adalah Long Interspered Nuclear Element (LINEs) dan Short Interspered Nuclear Element (SINEs). Perbedaan strukturnya dapat dilihat pada gambar berikut:

Gambar 2. Perbedaan struktur Retroelement. Type retroelement yang memiliki LTR
(retroviruses dan retrotransposons) dengan retroelement tanpa LTR (LINE dan SINE).
Sumber : Figure 2.27 (Brown, 2002)

Tidak semua transposisi membutuhkan RNA intermediete.Banyak gen dapat melakukan transposisi secara langsung dari DNA ke DNA. Transposisi secara langsung ini meliputi dua mekanisme antara lain:
1. Replicative transposition yaitu melalui interaksi langsung antara donor transposons dan sisi target.
2. Conservative transposition yaitu melalui penghilangan elemen transposons diikuti dengan penggabungan kembali pada sisi yang baru.
Mekanisme tersebut dapat dilihat pada gambar berikut :

Gambar 3. Dua Mekanisme Transposisi DNA transposons

Sumber : Figure 2.28 (Brown, 2002).

Seperti RNA transposons, DNA transposons juga memiliki beberapa tipe. Tipe DNA transposons yang umum terdapat pada prokaryotik antara lain :
1. Insertion sequences yaitu DNA transposons yang terdiri dari satu atau dua gen spesifik penyandi enzim transposase yang mengkatalisis transposisi
2. Composite transposons yaitu DNA transposons yang biasanya mengandung gen penyandi resistensi antibiotik. DNA transposons ini menggunakan mekanisme tranposisi conservative.

3. Tn3-type transposons yaitu DNA transposons yang memilki gen transposase sendiri dan biasanya menggunakan transposisi replikatif
4. Transposable transposons yaitu bakteriofag yang memiliki aktifitas transposisi replikatif sebagai bagian dari siklus infeksinya.
Berbagai tipe DNA transposons tersebut dapat dilihat pada gambar berikut :

Gambar 4. Tipe DNA transposons prokaryotik
Sumber : Figure 2.29 (Brown, 2002)

Daftar Pustaka
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.chapter.5449

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.section.5545

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.5555

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.5559

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.5563

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.5567

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.glossary.9089#10090

Diakses tanggal 24 September 2008

Situs terkait
http://jpk.sicau.edu.cn/2008jpk/fzswx/_private/animations/ch11_transposition.swf
[FLASH]

Diakses tanggal 26 September 2008

http://genomed.dlearn.kmu.edu.tw/ch11-2_transposition.swf [FLASH]

Diakses tanggal 13 Oktober 2008

A26149 kucrietz — Mon, 16 Jun 2008 13:23:01 +0000

sahabat sama seperti bintang

tak selalu terlihat setiap saat

bukannya dia menjauh

hanya terkadang ada awan yang menutupi

namun dibalik awan dia berjuang

tuk dapat selalu terlihat

sedekat yang pernah kau lihat

HARMFUL ALGA BLOOM CYANOBACTERIUM Microcystis aeruginosa

A26149 kucrietz — Fri, 16 May 2008 05:25:15 +0000

Harmful Alga Bloom (HAG) adalah istilah generik yang digunakan untuk mengacu pada pertumbuhan lebat mikroalga (plankton) di laut atau di perairan payau yang dapat menyebabkan kematian massal ikan, mengontaminasi makanan bahari (seafood) dengan toksin (racun yang diproduksi oleh mikroalga), sehingga mengubah ekosistem sedemikian rupa sehingga dipersepsikan manusia sebagai mengganggu (Geohab, 2000 dalam Sunrise, 2007). HAB dapat menyebabkan berubahnya warna air laut. Faktor yang dapat memicu terjadinya ledakan populasi fitoplankton tersebut diantaranya yaitu faktor alam yang dipicu oleh adanya pengayaan hara dari daratan yang menyebabkan terjadinya eutrofikasi (proses perkembangbiakan tumbuhan air dengan cepat karena memperoleh zat makanan yang melimpah akibat pemupukan yang berlebihan). Selain itu adanya faktor manusia yang dipicu oleh pembuangan limbah gas amoniak (NH₃) secara besar-besaran di udara. Cyanobacterium merupakan kelompok fitoplankton berbahaya dan merusak ekosistem perairan jika berada dalam kondisi sangat berlimpah. Plankton tersebut sewaktu-waktu dapat melimpah di perairan akibat kemampuannya mengikat nitrogen secara langsung dari udara. Microcystis aeruginosa merupakan anggota Cyanobacterium yang memiliki variasi tinggi dalam morfologi, toksisitas dan nilai pertumbuhan populasi maksimumnya. Nilai pertumbuhan ini ditentukan oleh variasi genetik sehingga berpotensi untuk terjadinya HAB. Wilson et al (2006) dalam sebuah studinya menyatakan bahwa nilai pertumbuhan Microcystis aeruginosa tidak mempengaruhi produksi toksin bagi masing-masing organismenya. Namun, bila nilai pertumbuhan ini maksimum pada taraf populasi hingga menimbulkan HAB maka tetap saja akan menjadi ancaman karena produksi toksin bertambah seiring dengan bertambahnya jumlah organisme.

Nama : Citra Dewi Febriani

NIM : B1J006149

http://kucrietzlophbatman.wordpress.com

kucrietz_1022ak@yahoo.co.id

Sumber :

Alan E. Wilson, Whitney A. Wilson, and Mark E. Hay (2006) Intraspecific Variation in Growth and Morphology of the Bloom-Forming Cyanobacterium Microcystis aeruginosa Appl. Envir. Microbiol. 72: 7386-7389. [Abstract] [Full Text] [PDF]

Sunrise, I. 2007. Air Laut Merah Rambah Perairan Aceh. http://www.acehforum.or.id/fenomena-air-laut-t5393.html?p=41669 . Diakses tanggal 15 Mei 2008.

Hello world!

A26149 kucrietz — Sun, 23 Mar 2008 03:29:44 +0000

Welcome to WordPress.com. This is your first post. Edit or delete it and start blogging!